宗庆后的祖籍是浙江杭州。

宗庆后是宋朝名将宗泽之后，十世祖宗瑞芝迁居杭州，形成钱塘宗氏。曾祖父宗承烈，浙江钱塘人，相继在湖北、四川做官，客死四川任上，官至正二品总督府步军统领官，归葬钱塘县。祖父宗继先，在武汉、广西做过官吏，广东为幕时主写粤汉铁路章程，后又做过张作霖的财政部长、汪氏南京国民政府警政部中将秘书官，死后安葬于杭州。父亲宗启騄，在宿迁邮局做过几年职员。

1945年，宗庆后出生于杭州。解放后，宗启騄失去了在宿迁的工作，于宗庆后4岁时，全家迁回杭州。