商家在运输珍珠时，为确保其不受磨损，通常会采取以下措施：

首先，使用柔软且防护性强的材料进行单独包装，如丝绸或天鹅绒；

其次，在珍珠周围填充防震材料，如气泡袋或珍珠棉，以减少在运输过程中的碰撞；

最后，确保包裹严密，防止在运输中因摩擦而受损。这些措施共同保护了珍珠的完整性和光泽。