体色。优质的甲鱼苗腹板应为桔红色，且颜色越红表示品质越好。如果腹板呈现淡红色或黄色，则表明其体质不佳。需要注意的是，当甲鱼苗体重达到20克后，腹板颜色转为灰白色或黑色是正常的。

体重。刚孵出的甲鱼苗，体重一般在3克以上为优质。如果体重不满3克，可能是因为亲本体重轻、年龄过小或营养不良，这样的甲鱼苗体质较差。

体态。好的甲鱼苗裙边比较厚实、平直。如果甲鱼苗的裙边软薄下垂，说明可能营养不良。另外，甲鱼苗的背腹及四肢腋窝处必须无白点或白斑，有的话则可能已经感染病菌。而且要选择无伤残、行动活泼、反应灵敏的甲鱼苗。

种质纯正。选择中华鳖苗时，应优先考虑那些来自中国长江、黄河两大水系的种苗。这些地区的鳖在营养、药用和经济价值方面较高，且具有较强的抗病能力。

非近亲繁殖。应避免选择近亲繁殖的种苗。近亲交配繁殖的鳖苗容易出现畸形，体弱多病，免疫能力差。