人资部门通过以下步骤计算薪酬：收集员工工时、绩效和奖金等相关数据。根据工资标准、合同和福利计划计算基本工资、加班费、奖金和其他应付项目。扣除员工的所得税、社保、住房公积金和其他法定扣款。

计算最终的净工资，并以银行转账或现金方式发放。