商丘古城的城门建造时间主要集中在明朝。现存地上的归德府城于明朝弘治十六年（公元 1503 年）开始建造，并于明朝正德六年（公元 1511 年）竣工。这表明商丘古城的城门建造主要发生在明朝时期。