内置黄芳碳底板和外置蓝芳碳底板在以下方面存在差异：

材料特性：蓝芳碳比黄芳碳更脆，而黄芳碳则比蓝芳碳更韧。这种差异使得蓝芳碳在快速相持时更具优势，而黄芳碳则更适合用于增加底劲。

重量和振幅：黄芳碳的重量比蓝芳碳重，同时黄芳碳的振幅较大，振动停止的比较慢，而蓝芳碳的振幅较小，振动停止的比较快。这种差异影响了底板的动态性能。

应用场合：蓝芳碳多用于外置纤维底板，如蝴蝶的vis，适合快速相持的打法。而黄芳碳多用于内置纤维底板，如龙五，用于增加底劲和深度吃球能力，制造旋转能力更强。

价格：黄芳碳的价格比蓝芳碳便宜，这也使得以前国产的纤维板多用黄芳碳，不过现在好的黄芳碳底板价格也不便宜。

总的来说，内置黄芳碳底板和外置蓝芳碳底板各有其独特的优势和适用场合。选择哪种底板主要取决于个人的技术特点、打法和预算等因素。