凤凰飞行器的飞行原理主要是基于热气球原理，在高空释放氦气，加热干燥的空气产生浮力，从而让凤凰飞行器飘浮在大气层中。

此外，凤凰飞行器还采用了太阳能电池板来获取能源，让其能够长时间在空中飞行。与传统飞行器相比，凤凰飞行器具有低成本、长时间飞行等优势，在研究气候变化、天气预报、环境监测等方面具有重要的应用价值。