闪闪元祖比万代贵的原因可能与其稀缺性、历史价值、品质以及市场供需关系有关。闪闪元祖可能是一款限量版或者特别版的模型，其生产数量有限，因此价格会相对较高。

此外，闪闪元祖也可能在细节设计、材质选择等方面更为出色，从而提高了其品质和价值。

最后，市场供需关系也会对价格产生影响，如果闪闪元祖的供应量较少而需求量较大，价格自然会上涨。当然，具体原因还需要根据具体情况来分析。