科莫多巨蜥幼年时期生活在水边，主要以小鱼和无脊椎动物为食。它们在繁殖季节诞生，处于弱小和易受攻击的状态，因此必须隐蔽自己并尽可能地避免被捕食者发现。

幼蜥通常会躲在水下沉睡，白天则会爬上河岸的树枝和根部，以避免被水中猎物攻击。幼年期通常持续一年左右，直到它们成年后变得更加高效地捕食。