广州中医药大学第三附属医院是广东省内医保定点医院，所以应该可以使用深圳医保卡。

但需要注意的是，医保卡的使用范围因地区和政策差异而有所不同。如果您是深圳的医保参保人，建议您在前往广州中医药大学第三附属医院前，先咨询深圳医保部门或相关医疗机构，了解具体的医保政策和使用规定。

此外，为了确保您的医保权益得到保障，您还需要注意以下几点：

确认医院的级别和是否为医保定点医院。

了解深圳医保卡在广东省内的使用范围和规定。

咨询深圳医保部门或相关医疗机构，了解具体的医保政策和使用规定。

在使用医保卡前，先咨询医院工作人员，了解具体的操作流程和使用注意事项。

总之，为了确保您的医保权益得到保障，建议您在前往广州中医药大学第三附属医院前，先咨询深圳医保部门或相关医疗机构，了解具体的医保政策和使用规定。