《斛珠夫人》中，卓英即方卓英，石榴即柘榴。关于他们是否最终在一起，这确实是一个让人心绪难平的问题。

虽然方卓英和柘榴两情相悦，但他们的命运却充满了波折。柘榴的眼睛被毒瞎，与鞠七七的恩怨纠葛难解。而方卓英不仅是方诸的爱徒，更是鹄库的王子，他的身份和使命让他无法与柘榴相守。

在原著中，柘榴为了让方卓英无牵无挂地回到他的母国，选择了自尽，这无疑是一个令人痛心的结局。而方卓英虽然最终统一了漠北，建立了自己的王国，但失去了柘榴的他，心中必定是无尽的遗憾和思念。

因此，从原著的角度来看，方卓英和柘榴并没有最终在一起。他们的爱情被命运和使命所阻隔，成为了一个无法弥补的遗憾。这样的结局虽然令人惋惜，但也正是《斛珠夫人》这部作品中深刻的人性描绘和命运无常的体现。

至于电视剧版本，具体的情节可能会有所不同，但无论如何，方卓英和柘榴这对苦命鸳鸯的命运都是让人牵肠挂肚的。希望你能在观看的过程中，找到属于自己的答案和感悟。