冻干粮和烘焙粮的主要区别是处理方式不同，冻干粮利用冷凝技术将水分全部蒸发，而烘焙粮则利用高温干燥的方式将水分迅速移除。两者各有优劣，冻干粮更符合有机食品原料的要求，而烘焙粮则具有更低的水分和更长的储存期限。