南通第三代社保卡（以下简称社保卡）是一种集成了社会保障和公共出行功能的智能卡片。在南通，持第三代社保卡可以方便地乘坐公交车。以下是具体的操作步骤：

1. 开通公交功能：您需要先到南通社保卡的发卡机构（如社保中心、银行等）办理社保卡的公交功能开通手续。开通后，您的社保卡将具备公共出行支付功能。

2. 刷卡乘车：乘坐公交车时，只需将社保卡靠近公交车上的刷卡机，刷卡机会自动扣除相应的车费。需要注意的是，社保卡刷卡乘车的优惠力度可能与普通公交卡有所不同，具体以当地政策为准。

3. 查询余额和消费记录：您可以通过社保卡发卡机构的官方网站或者APP查询社保卡的余额和消费记录，以便随时了解您的公交卡余额和乘车消费情况。

4. 充值：当社保卡公交功能余额不足时，您可以通过发卡机构的指定网点或者自助充值设备进行充值，以确保公交功能的正常使用。

总之，在南通使用第三代社保卡乘坐公交车非常方便。您只需开通公交功能，然后刷卡乘车即可。同时，您可以通过发卡机构的官方网站或者APP查询余额和消费记录，并在需要时进行充值。