根据自身情况和长跑能力选择。

男生可以选择200米，因为200米更考验速度和爆发力，适合速度快的同学。而女生选择800米更好，因为800米更考验耐力和持久力，适合耐力好的同学。

如果初中3年的长跑成绩都很好，可以选择200米，如果长跑成绩一般，可以选择800米更为保险。