支付宝免密支付是否会从另一个账号扣款，主要取决于这两个账号之间的关系以及支付设置。

首先，支付宝是以手机号为主体的，即使同一个身份证名下有两个账户，只要绑定的手机号不同，这些账户就是各自独立使用的。因此，在一般情况下，一个账户的免密支付不会直接从另一个账户扣款。

然而，如果用户在支付宝中设置了某种形式的关联或自动扣款顺序，例如，主账户余额不足时，按照用户设置的优先顺序从其他关联账户中扣款，那么免密支付可能会从另一个账号中扣款。但这种设置通常是用户自己主动进行的，并且需要明确授权。

总的来说，支付宝免密支付是否会从另一个账号扣款，取决于用户的账户设置和授权情况。为了避免不必要的麻烦和误解，建议用户定期检查并管理自己的支付宝账户设置，确保自己的支付安全。