申请保密证书需要按照国家相关法律法规和保密机构的要求进行申请。具体步骤如下：

首先，需要取得保密资格，即办理保密审查手续，获取保密资格证书；

然后，向所在单位的保密办申请保密审查并提交保密材料，获得评审结果；

最终，按照要求填写《保密协议书》、《知识产权归属声明书》等相关文件，提交申请材料进行审核，经批准后颁发保密证书。在申请保密证书时，需要严格遵守相关法律法规和保密机构的规定，确保所提交的材料真实、完整、合法。