原子恐龙和哥斯拉是两种不同的虚构角色，它们在设定、外观和起源等方面存在显著差异。

1. 起源：原子恐龙，又称机械哥斯拉，是1974年电影《机械哥斯拉的反击》中的角色，是一种以机械技术制作的恐龙型机动兵器。而哥斯拉则源于日本的历史人物及流行文化，最早在1954年的电影《哥斯拉》中作为核污染造成的怪兽登场。

2. 外观：原子恐龙的外观与恐龙相似，但全身覆盖着厚重的装甲，并拥有强大的机械结构和武器系统。而哥斯拉则通常呈现出一种类似蜥蜴和鳄鱼的混合体形象，身体上有厚重的皮肤和脊突，尾巴类似于鳄鱼。

3. 能力和设定：原子恐龙通常被描述为拥有强大的机械力量和武器系统，主要用于战斗和破坏。而哥斯拉则通常被设定为一种具有超强生命力和适应性的生物，能够抵抗各种攻击并具有强大的破坏力。

总的来说，原子恐龙和哥斯拉虽然都是虚构的角色，但它们在起源、外观和能力等方面存在明显的差异。