一般情况下是可以注销公司的。

注销公司的程序包括以下步骤:首先，需要成立清算小组，清理公司的资产并结束未了的业务。然后，向工商部门申请注销登记，并提交相关材料，如清算组负责人签署的注销登记申请书、营业执照等。接下来，选择一家主流报纸刊登注销公告。最后，进行税务注销登记。

需要注意的是，在办理公司注销程序之前，必须依法进行公司清算。此外，公司注销后，可能需要承担相应的责任。

综上所述，开票给对方公司但未转账时，可以按照上述步骤进行公司注销。