深圳跨区搬厂是否有赔偿，这取决于具体的合同条款和劳动法规。一般来说，如果劳动合同中有明确的约定，或者相关劳动法规有明确规定，那么在跨区搬厂时，员工是有可能获得赔偿的。然而，具体的赔偿金额和方式需要根据实际情况进行确定，建议员工与雇主进行积极沟通，了解具体的赔偿政策。同时，也可以咨询专业的法律机构或人士，以获取更详细的法律建议和指导。