论文查重39%是相对较低的，但具体是否合格需要根据学校或机构的要求来确定。

一般来说，如果论文的查重率在30%以下，就属于合格论文，不需要进行修改。如果论文的查重率在30%以上，就需要进行修改和降重，以符合学校或机构的要求。

因此，如果您的论文查重率为39%，需要根据学校或机构的要求来判断是否需要进一步修改和降重。同时，需要注意的是，不同的查重软件和数据库可能存在差异，因此在进行论文查重时应该选择可靠的查重软件和数据库。