假如您在工作过程中患上了甲亢，是否能得到工厂的赔偿，需要考虑以下几方面：

首先，需要判断甲亢是否与您的工作环境、工作任务等有关联，若无关联，则工厂不应承担赔偿责任；

其次，需要证明甲亢确实是在工作期间发病，如果是既往的慢性病、个体原因或者是在工作外因素诱发的，则不能认定为工伤；最后，需要遵照相关法规和程序，依据工伤认定标准进行申诉和鉴定。因此，一般情况下工厂不会自动赔偿，还需要具体分析具体情况。