司机不能擅自将车主的车子卖掉。

原因是，在法律上，车主拥有车辆的所有权，而司机只是拥有驾驶权。

如果司机擅自将车主的车子卖掉，将会涉及到侵犯车主的财产权和侵权行为。

此外，即使在某些特定情况下，司机需要处理车主的车辆问题，如车辆被违章扣押，司机也不能直接将车子私自出售。

应该先按照法律程序处理并与车主协商解决问题。

因此，司机应该尊重车主的权益，并在处理车辆问题时遵守法律程序和相关规定。