jgs档案和STEP格式的3D模型在多个方面存在显著差异。首先，jgs档案是谷歌地球的专有格式，主要用于存储和交换地理信息，包括3D模型。这些模型通常具有较为简单的几何形状和纹理，且在Google Earth中显示时能实现流畅的动画效果。然而，jgs档案的兼容性和可编辑性相对较低，通常只能通过Google Earth软件进行查看和编辑。

与之相比，STEP格式是一种国际通用的标准格式，用于描述和表示产品数据。STEP格式的3D模型具有更复杂的几何形状和更精细的纹理，能更准确地表示实际产品。此外，STEP格式的3D模型具有更高的兼容性和可编辑性，可以被多种CAD软件读取和编辑。这种格式的3D模型在工业设计和制造领域的应用尤为广泛。

总结来说，jgs档案和STEP格式的3D模型在应用领域、兼容性和可编辑性、几何形状和纹理复杂性等方面存在显著差异。在选择使用哪种格式时，需要根据具体需求和应用场景进行权衡。