在于它们的企业主体不同。

个体企业号是指个人独资经营的企业，法律上视为自然人；而公司企业号则是指由两个及以上的自然人、法人或其他组织共同投资、共同经营的企业，法律上视为法人实体。

因此，个体企业号和公司企业号在注册登记、财务纳税、法律责任等方面有所不同。

此外，公司企业号的组织管理和决策机制也更为规范和严格，而个体企业号的决策则通常由企业主自行决定。